Mezi více než 6 tisíci hlavními druhy stromů na Kubě vynikají borovice a mangrovové porosty. Mangrovy tvoří 26 % z celkově zalesněné plochy ostrova, pokrývají téměř 5 % pobřeží, chrání krajinu před erozí a poskytují útočiště malým rybám a ptákům.
Královskou palmu má Kuba jako národní strom ve státním znaku, zároveň tvoří emblém pivní značky Cristal. Poznáte ji snadno podle stvolu trčícího z koruny a hladkého kmene připomínajícího kámen. Rostou zde i kokosové palmy, palma barrigona s typickými boulemi na kmeni a též mimořádně vzácná, prehistorická palma korková.
Ve vyšších polohách, mezi 500 až 1 500 metry nad mořem, se nacházejí deštné pralesy. K jejich původním dřevinám patří erbovník a mahagonový strom, ale vzhledem k umělému zalesňování dnes převládá eukalypt, který je sice elegantní a romantický, avšak poněkud agresivní vůči ostatním rostlinným druhům.
Na Kubě rostou také tisíce druhů – často původních – kapradin, kaktusů a orchidejí. Národní květinu, bílý jasmín mariposu, poznáte podle omamné vůně a okvětních lístků připomínajících stejnojmenného motýla.
Ze čtrnáctky kubánských národních parků patří k nejznámějším šestice následujících.
| Název | Provincie | Rozloha (km2) | Popis | Rok zapsání na seznam UNESCO |
|---|---|---|---|---|
| Viňales | Pinar del Río | 111 | Údolí tabákových plantáží a vápencových útvarů (mogoty) | 1999 |
| Alejandro de Humboldt | Holguín, Guantánamo | 707 | Území s jedinečnou biologickou pestrostí | 2001 |
| Jardines de la Reina | Ciego de Ávila, Camagüey | 2 156 | Korálové souostroví „Královniny zahrady“ | |
| Desembarco del Granma | Granma | 326 | Útesy, kde začala Kubánská revoluce | 1999 |
| Pico Turquino | Granma, Santiago de Cuba | 232 | Nejvyšší bod Kuby (1 974 m) s deštným pralesem | |
| Ciénaga de Zapata | Matanzas | 4 189 | Bažinaté území s největším mokřadem v Karibiku |
Kuba sice není vyhlášenou přírodní lokalitou z hlediska volně žijící zvěře, nicméně zde žije 350 druhů ptáků. V některých oblastech máte příležitost spatřit nejmenšího ptáka na světě – kolibříka menšího než čmelák. Kubánský národní pták se jmenuje tocorro a má pírka v barvách státní vlajky – červená, modrá a bílá. Podle odborníků se na Kubě znovu objevila žluna královská, opeřenec považovaný již za vyhynulého.
Velcí savci byli lovem na Kubě téměř vyhubení. Údajně největší původní kubánský savec, čtyřkilový hlodavec stromová myš, přežívá na izolovaných ostrůvcích. K dalším zajímavým druhům patří motýl mariposa de cristal a vzácná ryba manjuarí, považovaná za živou fosilii.
